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關(guān)于WB實(shí)驗(yàn)中的marker,你應(yīng)該知道的事

更新時(shí)間:2024-10-23      點(diǎn)擊次數(shù):641

1、什么是蛋白marker?

 

蛋白Marker,也稱為蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)(Protein Molecular Weight Marker),是用于蛋白質(zhì)電泳分析中的一系列已知分子量的蛋白質(zhì)混合物。它們通常包含多個(gè)不同分子量的蛋白質(zhì)條帶,這些條帶在電泳過程中會(huì)根據(jù)分子量的大小和電荷差異遷移不同的距離,從而在凝膠上形成一系列有序的條帶。

 

2、Marker在WB中的作用?

 

分子量標(biāo)定:Marker包含一系列已知分子量的蛋白質(zhì),通過與Marker上的帶狀蛋白質(zhì)帶進(jìn)行比較,可以精確地確定待測(cè)蛋白的分子量;

驗(yàn)證電泳和轉(zhuǎn)印效果:Marker在電泳和轉(zhuǎn)印的過程中移動(dòng)到膜上,可以幫助研究者驗(yàn)證這些步驟的效果。通過檢查Marker的帶狀分布,可以確保電泳和轉(zhuǎn)印過程中沒有發(fā)生異常;

確定蛋白質(zhì)遷移距離:通過測(cè)量Marker的遷移距離,可以估算待測(cè)蛋白質(zhì)的遷移距離。這對(duì)于進(jìn)一步的數(shù)據(jù)分析和結(jié)果解釋非常重要;

標(biāo)定凝膠濃度:Marker還可以用于幫助研究者選擇適當(dāng)?shù)哪z濃度。不同分子量的Marker在不同的凝膠濃度下會(huì)產(chǎn)生不同的遷移模式,因此可以根據(jù)Marker的遷移特性選擇合適的凝膠濃度。

 

3、Marker有哪些分類,各有什么特點(diǎn)?

 

● 天然蛋白Marker:

 

這類Marker是從自然來源提取的蛋白質(zhì),它們經(jīng)歷了天然的修飾過程,如裂解、二硫鍵形成、糖基化或磷酸化,并保持其復(fù)雜的3D結(jié)構(gòu)。天然蛋白Marker更接近其在體內(nèi)的自然狀態(tài),這使得它們?cè)谒幬镩_發(fā)和生物醫(yī)學(xué)研究中非常有用。天然蛋白Marker可以提供更準(zhǔn)確的分子量估計(jì),因?yàn)樗鼈兾唇?jīng)過重組或合成,保持了蛋白質(zhì)的自然特性。abs9919非變性蛋白Marker (66-669kDa),經(jīng)過非變性電泳后,用考馬斯亮藍(lán)染色后可以得到分布均勻、密度相近的4條帶,不適用于SDS-Page,因?yàn)樵赟DS存在下,含有多個(gè)亞單位的蛋白會(huì)不同程度解聚。

 

abs9919非變性蛋白Marker(66-669kDa)

 

● 變性Marker:

 

這類Marker在生產(chǎn)過程中經(jīng)過了變性處理,通常是通過加熱和化學(xué)物質(zhì)(如SDS)的處理,以確保蛋白質(zhì)wan全展開成線性結(jié)構(gòu)。變性Marker的優(yōu)點(diǎn)在于它們提供了一致的蛋白質(zhì)遷移特性,這對(duì)于精確的分子量估計(jì)和實(shí)驗(yàn)重復(fù)性非常重要。由于變性處理,這類Marker的蛋白質(zhì)保持一致的電荷和形狀,使得它們?cè)陔娪具^程中的遷移更加可預(yù)測(cè)。

 

變性蛋白Marker一般可分為預(yù)染和非預(yù)染兩種

 

● 未預(yù)染蛋白Marker:

 

這類Marker包括寬分子量、高分子量和低分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)。它們是較簡(jiǎn)單、較準(zhǔn)確的一種,因?yàn)椴桓綆玖戏肿踊驑?biāo)記分子,所以所示大小正好是蛋白原本的大小。缺點(diǎn)是在電泳過程中不可見,需要在電泳結(jié)束后經(jīng)過染色才能看到,無法實(shí)時(shí)監(jiān)控電泳過程。適合精確判斷蛋白大小,但操作相對(duì)麻煩,需要額外的染色步驟。如abs9840非預(yù)染蛋白Marker (14.4-97.4kDa),用考馬斯亮藍(lán)R-250染色可得分布均勻密度相同的六個(gè)條帶,產(chǎn)品含SDS, 不適合用于非變性膠。

 

abs9840非預(yù)染蛋白Marker(14.4-97.4kDa)

 

● 預(yù)染蛋白Marker:

 

這類Marker在生產(chǎn)時(shí)就結(jié)合了染料,因此在電泳過程中或轉(zhuǎn)膜時(shí)可以直接觀察到不同顏色的條帶。預(yù)染蛋白Marker方便實(shí)驗(yàn)人員在電泳時(shí)、電泳后,以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測(cè)電泳情況和估計(jì)遷移率。又分為單色預(yù)染和多色預(yù)染。單色預(yù)染Marker通常會(huì)利用其中某些條帶加倍濃度來提示其大小,而多色預(yù)染Marker用不同的顏色來區(qū)別,更易于辨認(rèn) 。需要注意的是,預(yù)染蛋白Marker與染料共價(jià)耦聯(lián),所以在不同的緩沖條件下電泳時(shí)遷移特性可能會(huì)發(fā)生某些變化,可能導(dǎo)致一些偏差,因此不太適合精確定位蛋白。

 

abs923預(yù)染蛋白Marker(10-245kDa)

 

● 預(yù)染發(fā)光Western Marker

 

傳統(tǒng)的Western Blot試驗(yàn)需要使用預(yù)染蛋白Marker來跟蹤檢測(cè)陽性抗原信號(hào)和轉(zhuǎn)膜效率,但預(yù)染蛋白Marker無法在膠片上曝光,曝光信號(hào)需要根據(jù)膜上的預(yù)染蛋白Marker來判斷。absin新品abs90004 預(yù)染發(fā)光Western Marker由9種發(fā)光蛋白和9種預(yù)染蛋白組成;9中發(fā)光蛋白分別為23、30、36、44、50、62、90、120和160KDa,這些蛋白均可與抗體結(jié)合,因此能與抗原在同一張膜上曝出信號(hào),陽性信號(hào)可以直接通過Western Marker的位置來判斷;9種預(yù)染蛋白分別為15、25、35、40、55、70、100、130和180KDa,其中70KDa為紅色,其他為藍(lán)色,轉(zhuǎn)膜完畢后在膜上肉眼可見。

1)可與抗原同時(shí)檢測(cè)信號(hào),使Western blot結(jié)果判斷更加簡(jiǎn)便;

2)發(fā)光marker沒有偶聯(lián)和標(biāo)記其他分子,分子量更加準(zhǔn)確;

3)綜合發(fā)光marker和預(yù)染marker的優(yōu)勢(shì),既能監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)膜又能與抗原同時(shí)檢測(cè)。

 

HRP標(biāo)記的Goat anti mouse IgG二抗(一抗:mouse anti P38)ECL化學(xué)發(fā)光檢測(cè)

 

多重?zé)晒鈾z測(cè)

 

按照分子量又可以將marker分為高分子量、低分子量、寬分子量等。高分子量蛋白Marker是指那些用于檢測(cè)大分子量蛋白質(zhì)的標(biāo)記,通常包含的蛋白質(zhì)分子量范圍較高,它們提供的分子量范圍通常從幾十kDa到幾百kDa不等。低分子量蛋白Marker是指用于檢測(cè)小分子量蛋白質(zhì)的標(biāo)記,通常包含的蛋白質(zhì)分子量范圍較低,從幾kDa到幾十kDa的分子量范圍。寬分子量蛋白Marker是指覆蓋寬廣分子量范圍的標(biāo)記,通常包含從低到高多個(gè)分子量的蛋白質(zhì)。

 

4、如何選擇marker?需要考慮什么因素?

 

首先看實(shí)驗(yàn)類型,非變性蛋白需要非變性蛋白marker,變性蛋白則需要變性marker,兩者不可以相互替換,然后看目的蛋白大小,選擇相應(yīng)的marker,在可選條件下,寬分子量蛋白marker,是不錯(cuò)的選擇,另外看實(shí)驗(yàn)要求,如果需要在電泳和轉(zhuǎn)印過程中檢測(cè),需要選擇預(yù)染marker,如果需要精確的條帶分子量大小,則需要非預(yù)染marker做參考,可以同時(shí)使用預(yù)染marker和非預(yù)染marker,除了以上因素,還需要考慮marker的使用體系,absin常見marker信息如下:

 


類型

非變性蛋白marker

非預(yù)染蛋白 Marker

藍(lán)色預(yù)染蛋白 Marker

多色預(yù)染蛋白Marker

預(yù)染發(fā)光Western Marker

貨號(hào)

abs9919

abs9840

abs9511

abs9859

abs922

abs923

abs924

abs90004

分離量范圍

66-669kDa

14.4-97.4kDa

3.3-31kDa

14.4-97.4kDa

10-180kDa

10-245kDa(Tris-glycine-SDS)

10-180kDa

發(fā)光蛋白:23-160kDa

預(yù)染蛋白:15-180kDa

條帶數(shù)量

4

6

5

6

10(10和17可能因?yàn)槟z濃度原因跑不開)

12

10(10和17可能因?yàn)槟z濃度原因跑不開)

9

條帶分子量

66、238、440、669

14.4、22、31、43、66.2、97.4

3.3、6.5、14.4、20.1、31

14.4、20.1、31、43、66.2、97.4

10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

11、17、20、25、35、48、63、75、100、135、180、135、180、245(Tris-glycine-SDS)

10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

發(fā)光蛋白: 23、30、36、44、50、62、90、120 、 160

預(yù)染蛋白: 15、25、35、40、55、70、100、130 、 180

顏色

單色

單色

藍(lán)色

藍(lán)色

75紅色,25k綠色,其余藍(lán)色

25綠色,75橙紅色,其余藍(lán)色

72橙色,10綠色,其余藍(lán)色,10k條帶在15%以下膠濃度時(shí)深綠色

預(yù)染蛋白70KDa為紅色,其他為藍(lán)色,

推薦凝膠體系

非變性電泳

變性電泳

Tricine SDS-PAGE

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進(jìn)口一致

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進(jìn)口一致

Tris-Glycine
Bis-Tris MOPS
Bis-Tris MES

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進(jìn)口一致

Tris-Glycine,Bis-Tris等

處理

需要考馬斯亮藍(lán)染色,不能加熱

需要考馬斯亮藍(lán)染色及上樣前沸水浴

無需染色,勿加熱

無需染色、無需加熱

無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

無需染色、無需加熱

無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

無需染色、直接使用,不要煮沸




 

非變性蛋白電泳好物推薦


貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

abs9116

免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

100mL

abs9360

Tris-Glycine電泳緩沖液(10×)

500mL

abs9618

Glass gel預(yù)制膠 Tris-Gly 15%, 10wells, 1.5mm

10片/盒

abs9954

非變性非還原性蛋白上樣緩沖液(5×)

1mL×5

abs9919

非變性蛋白 Marker(66-669kDa)

200uL

abs964

考馬斯亮藍(lán)染色試劑盒(常規(guī)型)

1kit




 

WB好物推薦


 

貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

樣本處理

abs9346

細(xì)胞漿、細(xì)胞核及細(xì)胞膜蛋白抽提試劑盒

50T

abs9116

免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

100mL

abs9162

廣譜型磷酸酶抑制劑混合物(100×儲(chǔ)液)

1mL

abs9161

廣譜型蛋白酶抑制劑混合物(不含EDTA,100×DMSO儲(chǔ)液)

1mL

蛋白定量

abs9232

BCA蛋白定量試劑盒

500T

配膠試劑盒,各類預(yù)制膠(參考前面表格)

上樣與電泳

abs953

上樣緩沖液(2×)

10mL

abs951

電泳液(10×)

100mL

abs923

預(yù)染蛋白Marker(10-245kDa)

500uL

轉(zhuǎn)膜

abs932

PVDF膜(0.45μm)

20張

abs960

NC膜(0.45μm)

20張

abs950

電轉(zhuǎn)液(10×)

100mL

封閉

abs9175

脫脂奶粉

500g

abs9157

牛血清白蛋白

100g

抗體稀釋與去除

abs954

WB專用一抗二抗稀釋液

100mL

abs967

Western一抗二抗去除液(強(qiáng)堿性)

500mL

顯色與檢測(cè)

abs920

ECL化學(xué)發(fā)光檢測(cè)試劑盒

25mL×2




 

 

Absin產(chǎn)品線:

爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測(cè)、殘留檢測(cè)、多因子檢測(cè));細(xì)胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...

特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...

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