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WB試驗(yàn)之如何選擇內(nèi)參抗體

更新時(shí)間:2017-11-17      點(diǎn)擊次數(shù):6741

檢測(cè)某一個(gè)基因的表達(dá)產(chǎn)物或者要比較表達(dá)產(chǎn)物量的相對(duì)變化,方法是western blot。而Western Blot試驗(yàn)中比較這些的前提條件是等量的細(xì)胞上樣,這樣才有比較的基礎(chǔ)。而人為的操作會(huì)產(chǎn)生一定的誤差,這些誤差可以通過測(cè)定每個(gè)樣品中實(shí)際轉(zhuǎn)到膜上的內(nèi)參來校正。因此選擇一個(gè)合適的內(nèi)參抗體來校正上樣誤差是非常重要的。所以嚴(yán)謹(jǐn)?shù)腤estern Blot實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中需要有良好的參照體系,后續(xù)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析才具有說服性。

在Western Bloting實(shí)驗(yàn)中,可能內(nèi)參即是內(nèi)部參照(Internal Control),對(duì)于哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)來說一般是指由管家基因編碼表達(dá)的蛋白(Housekeeping Proteins),它們?cè)诟鹘M織和細(xì)胞中的表達(dá)相對(duì)恒定,在檢測(cè)蛋白的表達(dá)水平變化時(shí)常用它來做參照物。

在Western Blotting 中使用內(nèi)參其實(shí)就是在WB過程中的另外用內(nèi)參對(duì)應(yīng)的抗體檢測(cè)內(nèi)參,這樣在檢測(cè)目的產(chǎn)物的同時(shí)可以檢測(cè)內(nèi)參的表達(dá),由于內(nèi)參在各組織和細(xì)胞中的表達(dá)相對(duì)恒定,借助檢測(cè)每個(gè)樣品內(nèi)參的量就可以用于校正上樣誤差,這樣半定量的結(jié)果才更為可信。此外使用內(nèi)參可以作為空白對(duì)照,檢測(cè)蛋白轉(zhuǎn)膜情況是否*、整個(gè)Western Blot顯色或者發(fā)光體系是否正常。

常用的細(xì)胞總蛋白質(zhì)內(nèi)參有GAPDH、beta-actin和beta-tubulin等。對(duì)于一些植物的樣本,則需要特別的植物Actin蛋白作為內(nèi)參,同樣的,如果提取的樣本是細(xì)胞核蛋白,那么PCNA或者組蛋白H3都是被經(jīng)常使用的,而針對(duì)一些研究線粒體的客戶,那么Cox IV則被較多的文獻(xiàn)引用作為線粒體總蛋白的內(nèi)部參考。下面就常用的一些內(nèi)參抗體做一些介紹。

1.GAPDH抗體

GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)是參與糖酵解的一種關(guān)鍵酶,由4個(gè)30-40kDa的亞基組成,分子量146kDa,檢測(cè)條帶大約在36kDa。GAPDH基因幾乎在所有組織中都高水平表達(dá),被廣泛地用作Western blot蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)化的內(nèi)參。

 

2. β-Tubulin抗體

Tubulin即微管蛋白,是細(xì)胞的一種骨架蛋白。Tubulin分為α、β、γ、δ、ε等多種tubulin,其中α-Tubulin和β-Tubulin可以形成異源二聚體,是形成微管的zui主要的兩種Tubulin。α-tubulin和β-tubulin分子量分別為55kDa和50kDa,其實(shí)際檢測(cè)條帶均在55kDa左右。作為內(nèi)參,β-tubulin的蛋白水平通常不會(huì)發(fā)生改變,因此被廣泛用于Western Blotting時(shí)上樣量是否一致的參照,α-Tubulin和β-Tubulin構(gòu)成微管蛋白的結(jié)構(gòu)也常被用于免疫染色觀察細(xì)胞的微管結(jié)構(gòu)。

 

3. Beta-Actin內(nèi)參抗體

Actin即肌動(dòng)蛋白,是細(xì)胞的一種重要骨架蛋白。Actin大致可分為六種,其中四種是不同肌肉組織特異性的,其余兩種廣泛分布于各種組織中,包括 β-actin和γ-non-muscle actin。β-actin作為內(nèi)參是得到了*的,這是針對(duì)大多數(shù)組織和細(xì)胞來說的,它廣泛分布于細(xì)胞漿內(nèi),表達(dá)量非常豐富,其含量占所有細(xì)胞總蛋白的50%。但是在一些少量特殊的情況下,如脂肪組織或細(xì)胞β-Actin抗體推薦—價(jià)的內(nèi)參抗體內(nèi),β-Actin的表達(dá)量就很少。β-actin由375個(gè)氨基酸組成,分子量大小為42-43kDa左右。

 

那么如何選擇合適的內(nèi)參抗體呢?內(nèi)參抗體雖然選擇較多,但是也需要遵循一定的原則,并契合實(shí)際的應(yīng)用需要。推薦的內(nèi)參要與檢測(cè)的目的蛋白的分子量相差5KD以上,因此需要根據(jù)目的檢測(cè)蛋白的分子量來選擇合適的內(nèi)參,例如:GAPDH的檢測(cè)分子量大約在36kD,因此該內(nèi)參抗體不是很適合用于檢測(cè)30kD-40kD大小目標(biāo)蛋白的WB實(shí)驗(yàn)中;β-Actin的檢測(cè)分子量大約在42kD,因此該內(nèi)參抗體不是很適合用于檢測(cè)38kD-48kD大小目標(biāo)蛋白的WB實(shí)驗(yàn)中。另外,不同的組織來源的樣本在選擇內(nèi)參時(shí)還有一定的區(qū)別。比如某些細(xì)胞中,由于組織缺氧、糖尿病等因素會(huì)導(dǎo)致GAPDH的表達(dá)增高,不適合做內(nèi)參。另外,雖然β-Actin是zui合適的內(nèi)參抗體之一,但是在某些條件下,一些因素也會(huì)導(dǎo)致樣品間β-Actin含量的變化,例如在脂肪組織里,β-Actin的表達(dá)量非常低,就不適合作為內(nèi)參。

 

就一般的蛋白檢測(cè)來說,β-actin、β-Tubulin抗體等就可以了,而針對(duì)于核蛋白的定量,特別是樣本蛋白就是核蛋白時(shí),選擇恰當(dāng)?shù)暮说鞍變?nèi)參則更能體現(xiàn)內(nèi)部參照的價(jià)值。常用的核內(nèi)參抗體有Lamin A、Lamin B、Histone H3,除此之外,其它常見的核蛋白內(nèi)參還有PCNA、K70、K80等,在一些文獻(xiàn)報(bào)道中,Erk2、TATA binding protein(TBP)以及c-Jun、c-Fos等都有使用。而對(duì)于膜蛋白檢測(cè),常用的內(nèi)參抗體為Na,K ATPase。對(duì)于線粒體蛋白的檢測(cè),常用VDAC1和COX IV作為內(nèi)參抗體。

以上幾條原則只是針對(duì)通常情況,但是需要注意的問題是——內(nèi)參的選擇需要考慮實(shí)際的試驗(yàn)環(huán)境并查詢相應(yīng)文獻(xiàn),在實(shí)驗(yàn)過程中也應(yīng)該注意如果內(nèi)參表達(dá)出現(xiàn)異常,應(yīng)綜合考慮這方面因素。

 

愛必信部分內(nèi)參抗體訂購(gòu)信息如下,更多內(nèi)參抗體信息詳情見。

貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

反應(yīng)種屬

應(yīng)用

來源種屬

規(guī)格

abs830030

Anti-GAPDH Antibody

Human, mouse, African green monkey

WB,IP

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs118936        

GAPDH Polyclonal Antibody

Human Mouse Rat

WB, IHC, IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs130609

GAPDH Antibody

H, Mk

WB

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs132004

GAPDH antibody

Human, Mouse, Rat

WB,IHC, IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs137959

GAPDH Mouse Monoclonal Antibody

H, R, M, Mk, Dg, Ch, Hm, Rabbit,Pg

WB, IHC, IF

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs124037

Rabbit Anti-GAPDH Polyclonal Antibody

Human, Mouse, Rat, Rabbit,

WB,IHC-P,IHC-F,IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs139055

GAPDHS Antibody

Human

WB

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs100531

GAPDH Antibody, HRP Conjugate

Human

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs830031

Anti-beta actin Antibody

human. mouse, African green monkey

WB、IP

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs132001

Beta actin antibody

Zebrafish,Dog,Monkey,Human,Mouse,Rat,Pig

WB,IHC,IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs119600

Rabbit Anti-beta Actin Polyclonal Antibody

Human, Mouse, Rat, Chicken, Dog, Pig, Cow, Rabbit, Sheep , Bee, Fish, Guinea Pig, Hamster, Goat, Cat, mt,op

WB,ELISA,IHC-P,IHC-F,Flow-Cyt,IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs137975

beta-Actin Mouse Monoclonal Antibody

Human; Monkey; Mouse; Rat; hamster; Dog; Spodoptera frugiperda; chicken,rabbit.Pg

WB, IHC, IF/ICC

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs112431

Beta-Actin Antibody

H, R

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs830032

Anti-β-tubulin Antibody

human. mouse, African green monkey

WB,IP

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs119784

Rabbit Anti-Tubulin-beta Polyclonal Antibody

Human, Mouse, Rat, Pig, Cow

ELISA,IHC-P,IHC-F,Flow-Cyt,IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs131994

Tubulin beta Antibody

Human, Mouse, Rat

WB, IHC

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs137981

Tubulin beta Antibody

Zebrafish

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs112431

Beta-Actin Antibody

H, R

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs132184

beta-Actin antibody

Human,Mouse,Hamster,Rat,Monkey

ELISA, WB, ICC, FCM

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs137975

beta-Actin Mouse Monoclonal Antibody

Human; Monkey; Mouse; Rat; hamster; Dog; Spodoptera frugiperda; chicken,rabbit.Pg

WB, IHC, IF/ICC

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs100041

Beta-Actin Antibody

H, M, R

IHC-P, IF, WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs100006

Beta-actin Antibody

H, M, R

WB, IHC-P

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs100462

Histone H3 Antibody

H, R, M

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs112443

Histone H3 Antibody

H, R

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

愛必信特色產(chǎn)品線:

生化試劑(60萬種)、抗體(10萬種)、細(xì)胞因子、二抗、預(yù)制膠、ECL發(fā)光液、預(yù)染marker、激動(dòng)劑、抑制劑、凋亡試劑盒、BSA、動(dòng)植物提取物、蛋白酶K、血清、組化筆...

 

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