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探秘黑膠蟲(上)

更新時(shí)間:2023-05-19      點(diǎn)擊次數(shù):745

黑膠蟲污染是一個(gè)老生常談的話題。目前,科研界對黑膠蟲的污染特征沒有統(tǒng)一的判定標(biāo)準(zhǔn),通常污染特征總結(jié)有:

1)活躍游動(dòng)或旋轉(zhuǎn)梭動(dòng)或原地顫動(dòng)(如視頻1、2、3所示);



視頻1 活躍游動(dòng)


視頻2 旋轉(zhuǎn)梭動(dòng)


視頻3 原地顫動(dòng)


2)
呈桿狀、球狀、卵圓狀;

3)培養(yǎng)基不渾濁;

4)復(fù)蘇或傳代時(shí)往往會(huì)出現(xiàn)黑膠蟲污染,并且與細(xì)胞呈現(xiàn)此消彼長的現(xiàn)象。

我們對多個(gè)黑膠蟲樣本進(jìn)行測序鑒定,這里舉兩個(gè)典型鑒定結(jié)果給大家分享:



圖1 Sphingomonas(鞘氨醇單胞菌)單個(gè)及菌落圖

屬名

樣本2,15,21,27鑒定為Sphingomonas sp.(鞘氨醇單胞菌屬)

能否游動(dòng)

以單側(cè)生極性鞭毛運(yùn)動(dòng)

類別

G-菌

形狀

桿狀;菌落為黃色

大小

0.3-0.8 * 1.0-2.7µm

特點(diǎn)

該菌屬至今共有12個(gè)種,是一類豐富的新型微生物資源,可用于芳香化合物的生物降解,在環(huán)境保護(hù)及工業(yè)生產(chǎn)方面具有巨大的應(yīng)用潛力

分布范圍

河水、根際、地表及深層的地下的沉積物、海洋,連極地土壤中都有它們的蹤跡


圖2 Brevundimonas vesicularis(泡囊假單胞菌)單個(gè)及菌落圖

屬名

樣本4,19鑒定為Brevundimonas vesicularis(泡囊假單胞菌)屬于Brevundimonas sp.(短波單胞菌屬)

類別

G-菌

形狀

桿狀;菌落為圓形,凸起,表面濕潤光滑,邊緣整齊

大小

0.4-0.5X 1-2μm

代表種

泡囊短波單胞菌是一種較罕見的非發(fā)酵性病原性假單胞菌,在人體可引起肺炎、敗血癥、皮膚炎癥和壞死性蜂窩織炎等

分布范圍

通常存在于土壤、河流等自然界中


這些黑膠蟲樣本被鑒定為細(xì)菌。另外我們也查閱了大批文獻(xiàn),十幾年前就有人做了相關(guān)研究,很多都鑒定為細(xì)菌,例如以下這篇[1]



圖3 客戶文獻(xiàn)截圖


這篇文章講述的是,首先從黑膠蟲污染細(xì)胞樣本中分離得到黑膠蟲,然后從黑膠蟲中提取基因組
DNA進(jìn)行基因測序及分析,鑒定出的黑膠蟲為無色桿菌屬(Achromobacter)

細(xì)菌已經(jīng)在地球上存在三十多萬年了,具有不同的形狀,根據(jù)形狀主要分為三類,即:球菌、桿菌和螺旋菌(包括弧菌、螺菌、螺桿菌)(圖4)。鞭毛是著生在細(xì)菌表面的絲狀運(yùn)動(dòng)器官。由于鞭毛很細(xì),只有用特殊的染色法,才能用光學(xué)顯微鏡觀察到。直徑12~25nm,長3~12μm,柔軟、波形(圖5)。


圖4 細(xì)菌模式圖和細(xì)菌形狀分類



圖5 細(xì)菌鞭毛分布圖

單生(一根鞭毛著生于一端)

雙生(兩根鞭毛分別著生于兩端)

單叢生(一叢鞭毛著生于一端)

雙叢生(兩叢鞭毛分別著生于兩端)

周生(多根鞭毛遍布于菌體上)


鞭毛有三種運(yùn)動(dòng)方式:在液體中泳動(dòng),在固體表面上滑行,在液體中旋轉(zhuǎn)梭動(dòng)。所以難怪,我們看到的黑膠蟲不是在液體中活躍游動(dòng),就是在液體中旋轉(zhuǎn)梭動(dòng),這就和黑膠蟲被鑒定為細(xì)菌的結(jié)果相吻合了。

黑膠蟲污染頑固,如何消殺,胞胞巴適有秘方——黑膠蟲清除劑,其所含有的多肽活性成分,相比傳統(tǒng)抗生素有效清除黑膠蟲;清除周期短,視黑膠蟲污染程度通常3-6天可有效去除;廣譜性強(qiáng),可有效清除常見支原體污染。


本期講解就到這了,請持續(xù)關(guān)注愛必信公眾號,等待探秘黑膠蟲(下)。

[1] Jennifer Sue Gray, Janette Marie Birmingham, Jenifer Imig Fenton. Got black swimming dots in your cell culture? Identification of Achromobacter as a novel cell culture contaminant[J]. Biologicals, 2010, 38(2):273-7.

注:圖源網(wǎng)絡(luò)和客戶,僅供參考學(xué)習(xí)用。


表1 細(xì)胞培養(yǎng)類產(chǎn)品推薦

貨號

品名

規(guī)格

abs981

胎牛血清(特級)

500ml

abs972

胎牛血清(優(yōu)級)

500ml

abs974

胎牛血清(標(biāo)準(zhǔn)級)

500ml

abs9483

高糖DMEM培養(yǎng)基

500ml

abs9484

RPMI-1640培養(yǎng)基

500ml

abs9505

MEM培養(yǎng)基

500ml

abs9506

α-MEM培養(yǎng)基

500ml

abs9554

Ham's F-12培養(yǎng)基

500ml

abs9563

Ham's F-12K培養(yǎng)基

500ml

abs9561

DMEM/F-12培養(yǎng)基

500ml

abs962

PBS緩沖液

500ml

abs970

D-PBS緩沖液(不含 Ca2+ Mg2+

500ml

abs971

D-PBS緩沖液(含 Ca2+ Mg2+)

500ml

abs9257

Hanks平衡鹽溶液(不含 Ca2+ Mg2+)

500ml

abs9258

Hanks平衡鹽溶液(含 Ca2+ Mg2+)

500ml

abs47014938

胰蛋白酶-EDTA消化液(0.25%),含酚紅

100ml

abs47047375

胰蛋白酶-EDTA消化液(0.25%),不含酚紅

100mL

abs9479

無DMSO無血清細(xì)胞凍存液

100mL

abs9417

無血清細(xì)胞凍存液

100mL

abs9473

細(xì)胞凍存液(含血清)

100mL

abs9474

組織保存液

100ml

abs9480

組織凍存試劑盒

30ml

abs9486

模具

1個(gè)/套

abs9487

小刀

5片/包

abs9481

組織復(fù)蘇試劑盒

50ml

abs9648

黑膠蟲清除劑

200ul

abs42020125

卡那霉素B硫酸鹽

250mg

abs42018967

硫酸慶大霉素溶液

10ml

abs9244

青鏈雙抗

100ml

abs9245

青霉素-鏈霉素-慶大霉素混合溶液

100ml

abs42013298

兩性霉素B

1g

abs44071148

制霉菌素

1g

abs9246

青霉素-鏈霉素-兩性霉素B混合溶液

100ml

abs9252

支原體檢測試劑盒

100T

abs9375

支原體清除試劑

200uL×5

abs9376

支原體預(yù)防

500uL×4

abs816578

環(huán)丙沙星鹽酸鹽

500mg

abs9374

水盤抑菌劑

20ml

abs9371

水浴鍋抑菌劑

100ml

abs9372

培養(yǎng)箱除菌劑

480ml

abs9373

細(xì)胞房除菌劑

480ml




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